Jørn Henneby Nielsen startede selvstændig, rådgivende ingeniørvirksomhed i 1981. Siden 1985 har rådgivende ingeniørfirma Henneby Nielsen været medlem af Foreningen af Rådgivende Ingeniører F.R.I.
30 juni 1999 omdannedes den personligt ejede virksomhed til aktieselskab som et led i forberedelserne til en videreudvikling af virksomheden og et planlagt generationsskifte.